Ancak birçok hastalık pıhtılaşma sisteminin anormal fonksiyonuna yol açacağı gibi kan damarının intimasında da hasara neden olacak ve kanın durması, fibrinolitik sistemin trombüsü çözemeyecek kadar geç kalmasına veya yetersiz kalmasına neden olacaktır.
Örneğin akut miyokard enfarktüsünde kalp damarlarında tromboz meydana gelir.Kan damarlarının durumu çok kötüdür, çeşitli intima hasarı vardır ve darlıklar vardır, buna kan akışındaki durgunluk da dahildir, trombüsü çözmenin bir yolu yoktur ve trombüs giderek büyüyecektir.

Örneğin uzun süre yatalak kalan kişilerde bacaklardaki lokal kan akışı yavaşlar, kan damarlarının intiması zarar görür ve trombüs oluşur.Trombüs çözünmeye devam edecektir, ancak çözünme hızı yeterince hızlı değildir, düşebilir, kan sistemi boyunca pulmoner artere geri akabilir, pulmoner arterde sıkışıp kalabilir ve yine ölümcül olan pulmoner emboliye neden olabilir.
Şu anda hastaların güvenliğini sağlamak için yapay olarak tromboliz yapmak ve trombolizi teşvik etmek için kullanılan "ürokinaz" gibi ilaçları enjekte etmek gerekir.Ancak trombolizin genellikle 6 saat gibi kısa bir tromboz süresi içinde gerçekleştirilmesi gerekir.Uzun zaman alırsa çözülmez.Bu sırada trombolitik ilaçların kullanımını artırırsanız vücudun diğer bölgelerinde kanamalara neden olabilir.
Trombüs çözülemez.Tamamen tıkanmamışsa, düzgün kan akışını sağlamak için tıkalı kan damarını "çekerek açmak" için bir "stent" kullanılabilir.

Ancak damarın uzun süre tıkanması önemli doku yapılarının iskemik nekrozuna neden olacaktır.Şu anda, kan akışını kaybetmiş bu doku parçasını "sulamak" için yalnızca diğer kan damarları "bypass edilerek" kullanılabilir.

Kanama ve pıhtılaşma, tromboz ve tromboliz, vücudun metabolik aktivitelerini koruyan hassas dengedir.Sadece bu da değil, insan vücudunda sempatik sinir ve vagus siniri gibi insanı fazla heyecanlandırmadan, uyarılabilirliğini koruyan pek çok ustaca denge vardır;insülin ve glukagon kişilerin kan şekeri dengesini düzenler;kalsitonin ve paratiroid hormonu insanların kan şekerini düzenler.