Po nastanku tromboze se njena struktura spremeni pod vplivom fibrinolitičnega sistema in šoka krvnega pretoka ter regeneracije telesa.

Obstajajo 3 glavne vrste končnih sprememb v trombih:

1. Zmehčati, raztopiti, absorbirati

Po nastanku tromba fibrin v njem vsrka veliko količino plazmina, tako da fibrin v trombu postane topen polipeptid in se raztopi, tromb pa se zmehča.Ker nevtrofilci v strdku razpadejo in sproščajo proteolitične encime, se hkrati lahko tromb tudi raztopi in zmehča.

Majhen tromb se raztopi in utekočini ter ga lahko krvni obtok popolnoma absorbira ali spere, ne da bi zapustil sled.

Večji del tromba se zmehča in zaradi krvnega obtoka zlahka odpade in postane embolus.Emboli s pretokom krvi blokirajo ustrezno žilo, kar lahko povzroči embolijo, preostali del pa se organizira.

2. Mehanizacija in rekanalizacija

Večjih trombov ni enostavno raztopiti in popolnoma absorbirati.Običajno v 2 do 3 dneh po nastanku tromba zraste granulacijsko tkivo iz poškodovane vaskularne intime, kjer je tromb pritrjen, in postopoma nadomesti tromb, kar imenujemo trombna organizacija.
Ko je tromb organiziran, se tromb skrči ali delno raztopi, v notranjosti tromba ali med trombom in žilno steno pa pogosto nastane razpoka, površino pa prekrijejo proliferirajoče vaskularne endotelijske celice in na koncu ena ali več majhnih krvnih žil ki komunicirajo s prvotno krvno žilo.Rekanalizacija krvnega obtoka se imenuje rekanalizacija tromba.

3. Kalcifikacija

Majhno število trombov, ki jih ni mogoče popolnoma raztopiti ali organizirati, lahko kalcijeve soli precipitirajo in kalcificirajo, pri čemer nastanejo trdi kamni v krvnih žilah, imenovani fleboliti ali arterioliti.