Após a formação da trombose, sua estrutura muda sob a ação do sistema fibrinolítico e do choque do fluxo sanguíneo e da regeneração do corpo.

Existem 3 tipos principais de alterações finais em um trombo:

1. Suavizar, dissolver, absorver

Após a formação do trombo, a fibrina nele contida absorve uma grande quantidade de plasmina, de modo que a fibrina no trombo se torna um polipeptídeo solúvel e se dissolve, e o trombo amolece.Ao mesmo tempo, como os neutrófilos no trombo se desintegram e liberam enzimas proteolíticas, o trombo também pode ser dissolvido e amolecido.

O pequeno trombo se dissolve e liquefaz, podendo ser completamente absorvido ou eliminado pela corrente sanguínea sem deixar vestígios.

A maior parte do trombo é amolecida e cai facilmente pelo fluxo sanguíneo para se tornar um êmbolo.Os êmbolos bloqueiam o vaso sanguíneo correspondente ao fluxo sanguíneo, o que pode causar embolia, enquanto o restante é organizado.

2. Mecanização e Recanalização

Os trombos maiores não são fáceis de dissolver e absorver completamente.Geralmente, dentro de 2 a 3 dias após a formação do trombo, o tecido de granulação cresce a partir da íntima vascular danificada onde o trombo está inserido e gradualmente substitui o trombo, o que é chamado de organização do trombo.
Quando o trombo é organizado, o trombo encolhe ou se dissolve parcialmente, e uma fissura é frequentemente formada dentro do trombo ou entre o trombo e a parede do vaso, e a superfície é coberta por células endoteliais vasculares em proliferação e, finalmente, um ou vários pequenos vasos sanguíneos que se comunicam com o vaso sanguíneo original são formados.A recanalização do fluxo sanguíneo é chamada de recanalização do trombo.

3. Calcificação

Um pequeno número de trombos que não podem ser completamente dissolvidos ou organizados podem ser precipitados e calcificados pelos sais de cálcio, formando pedras duras existentes nos vasos sanguíneos, denominadas flebólitos ou arteriolitos.