שיטות הטיפול בפקקת כוללות בעיקר טיפול תרופתי וטיפול כירורגי.הטיפול התרופתי מתחלק לתרופות נוגדות קרישה, תרופות נוגדות טסיות ותרופות טרומבוליטיות לפי מנגנון הפעולה.ממיס נוצר פקקת.חלק מהחולים העונים על ההתוויות יכולים להיות מטופלים גם בניתוח.
1. טיפול תרופתי:
1) נוגדי קרישה: הפרין, וורפרין ונוגדי קרישה חדשים דרך הפה נמצאים בשימוש נפוץ.להפרין יש השפעה נוגדת קרישה חזקה in vivo ו-in vitro, שיכול למנוע ביעילות פקקת ורידים עמוקים ותסחיף ריאתי.הוא משמש לעתים קרובות לטיפול באוטם חריף בשריר הלב ובתרומבואמבוליזם ורידי.יש לציין שניתן לחלק את הפרין להפרין לא מפורק ולהפרין במשקל מולקולרי נמוך, האחרון בעיקר בהזרקה תת עורית.Warfarin יכול למנוע הפעלת גורמי קרישה תלויי ויטמין K.זהו נוגד קרישה ביניים מסוג דיקומרין.הוא משמש בעיקר לחולים לאחר החלפת מסתם לב מלאכותי, חולי פרפור פרוזדורים בסיכון גבוה ותרומבואמבוליזם.דימום ותגובות שליליות אחרות דורשות מעקב צמוד אחר תפקוד הקרישה במהלך הטיפול התרופתי.נוגדי קרישה פומיים חדשים הינם נוגדי קרישה דרך הפה בטוחים ויעילים יחסית בשנים האחרונות, כולל תרופות סבן ו-dabigatran etexilat;
2) תרופות נוגדות טסיות: כולל אספירין, קלופידוגרל, אבציקסימאב וכו', יכולות לעכב את הצטברות הטסיות, ובכך לעכב את היווצרות הפקקת.בתסמונת כלילית חריפה, נעשה שימוש בדרך כלל בשילוב עם הרחבת בלון בעורק הכלילי ומצבים פקקים גבוהים כגון השתלת סטנט, אספירין וקלופידוגרל;
3) תרופות טרומבוליטיות: כולל סטרפטוקינאז, אורוקינאז ומפעיל פלסמינוגן של רקמות וכו', שיכולות לקדם תרומבוליזה ולשפר את הסימפטומים של החולים.
2. טיפול כירורגי:
כולל כריתת פקקת כירורגית, פקקת צנתר, אבלציה קולית ושאיבת פקקת מכנית, יש צורך להבין היטב את האינדיקציות והתוויות הנגד של הניתוח.מבחינה קלינית, נהוג לחשוב שחולים עם פקקת משני הנגרמים על ידי פקקת ישנה, הפרעות בתפקוד קרישה וגידולים ממאירים אינם מתאימים לטיפול כירורגי, ויש לטפל בהם בהתאם להתפתחות מצבו של המטופל ובהנחיית רופא.