घनास्त्रता बनने के बाद, इसकी संरचना फाइब्रिनोलिटिक प्रणाली और रक्त प्रवाह के झटके और शरीर के पुनर्जनन के प्रभाव में बदल जाती है।

थ्रोम्बस में 3 मुख्य प्रकार के अंतिम परिवर्तन होते हैं:

1. नरम करना, घोलना, सोखना

थ्रोम्बस बनने के बाद, इसमें मौजूद फाइब्रिन बड़ी मात्रा में प्लास्मिन को अवशोषित करता है, जिससे थ्रोम्बस में फाइब्रिन एक घुलनशील पॉलीपेप्टाइड बन जाता है और घुल जाता है, और थ्रोम्बस नरम हो जाता है।साथ ही, क्योंकि थ्रोम्बस में न्यूट्रोफिल विघटित होते हैं और प्रोटीयोलाइटिक एंजाइम छोड़ते हैं, थ्रोम्बस को भी भंग और नरम किया जा सकता है।

छोटा थ्रोम्बस घुल जाता है और द्रवीकृत हो जाता है, और बिना कोई निशान छोड़े रक्तप्रवाह द्वारा पूरी तरह से अवशोषित या धोया जा सकता है।

थ्रोम्बस का बड़ा हिस्सा नरम हो जाता है और रक्त प्रवाह से आसानी से गिर कर एम्बोलस बन जाता है।एम्बोली रक्त प्रवाह के साथ संबंधित रक्त वाहिका को अवरुद्ध कर देती है, जिससे एम्बोलिज्म हो सकता है, जबकि शेष भाग व्यवस्थित रहता है।

2. मशीनीकरण और पुनर्संयोजन

बड़े थ्रोम्बी को पूरी तरह से घुलना और अवशोषित करना आसान नहीं होता है।आमतौर पर, थ्रोम्बस बनने के 2 से 3 दिनों के भीतर, दानेदार ऊतक क्षतिग्रस्त संवहनी इंटिमा से बढ़ता है जहां थ्रोम्बस जुड़ा होता है, और धीरे-धीरे थ्रोम्बस को बदल देता है, जिसे थ्रोम्बस संगठन कहा जाता है।
जब थ्रोम्बस व्यवस्थित होता है, तो थ्रोम्बस सिकुड़ जाता है या आंशिक रूप से घुल जाता है, और अक्सर थ्रोम्बस के अंदर या थ्रोम्बस और वाहिका की दीवार के बीच एक दरार बन जाती है, और सतह संवहनी एंडोथेलियल कोशिकाओं के प्रसार से ढक जाती है, और अंत में एक या कई छोटी रक्त वाहिकाएं जो मूल रक्त वाहिका के साथ संचार करके बनते हैं।रक्त प्रवाह के पुनरावर्तन को थ्रोम्बस का पुनरावर्तन कहा जाता है।

3. कैल्सीफिकेशन

थ्रोम्बी की एक छोटी संख्या जिसे पूरी तरह से विघटित या व्यवस्थित नहीं किया जा सकता है, कैल्शियम लवण द्वारा अवक्षेपित और कैल्सीकृत हो सकती है, जिससे रक्त वाहिकाओं में मौजूद कठोर पत्थर बन जाते हैं, जिन्हें फ़्लेबोलिथ या आर्टेरियोलिथ कहा जाता है।