Efter at trombose er dannet, ændres dens struktur under påvirkning af fibrinolytisk system og blodgennemstrømningschok og regenerering af kroppen.

Der er 3 hovedtyper af endelige ændringer i en trombe:

1. Blødgør, opløs, absorber

Efter at tromben er dannet, optager fibrinen i den en stor mængde plasmin, så fibrinen i tromben bliver et opløseligt polypeptid og opløses, og tromben blødgøres.På samme tid, fordi neutrofilerne i tromben desintegrerer og frigiver proteolytiske enzymer, kan tromben også opløses og blødgøres.

Den lille trombe opløses og bliver flydende og kan absorberes fuldstændigt eller skylles væk af blodbanen uden at efterlade spor.

Den største del af tromben blødgøres og falder let af blodgennemstrømningen og bliver til en embolus.Embolierne blokerer det tilsvarende blodkar med blodgennemstrømningen, hvilket kan forårsage emboli, mens den resterende del er organiseret.

2. Mekanisering og rekanalisering

Større tromber er ikke nemme at opløse og absorbere fuldstændigt.Normalt inden for 2 til 3 dage efter trombedannelse vokser granulationsvæv fra den beskadigede vaskulære intima, hvor tromben er fæstnet, og erstatter gradvist tromben, som kaldes trombeorganisation.
Når tromben er organiseret, skrumper tromben eller opløses delvist, og der dannes ofte en fissur inde i tromben eller mellem tromben og karvæggen, og overfladen dækkes af prolifererende vaskulære endotelceller, og til sidst en eller flere små blodkar der kommunikerer med det oprindelige blodkar dannes.Rekanalisering af blodgennemstrømningen kaldes rekanalisering af tromben.

3. Forkalkning

Et lille antal tromber, der ikke kan opløses fuldstændigt eller organiseres, kan udfældes og forkalkes af calciumsalte og danner hårde sten, der findes i blodkarrene, kaldet flebolitter eller arteriolitter.